Новости лаборатории Наномир

  Все выпуски  

769 Сотовая четвертичная структура белка OLQ02947


Выпуск 769

Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

Сотовая четвертичная структура белка OLQ02947

раскрывает тайны цитоскелета 

 Symbiodinium microadriaticum.

Увеличить

Схема вторичной структуры фрактальной гипер-спирали белка, состоящей из чередующихся альфа-спиральных участков (красный), пи-спиральных участков (голубой) и 310-спиральных участков (оранжевый). 

Фрагменты этой спирали встречаются в нескольких белках: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LSRX01000158.1 

 

В проекции гиперспираль (трёхгранная призма) будет иметь вид треугольника.


Две антинаправленные призмы образуют в проекции ромб.


Шесть призм образуют в проекции правильный шестиугольник, которым можно заполнить плоскость.

 

 

 

Скрипт для 3DS Max:

-- Actin cytoskeleton organization. Picotechnological model
-- Nanoworld Laboratory. Alexander Kushelev
-- http://nanoworld.narod.ru
c1 = cylinder radius:1 height:10 sides:6 height_segments:1  wirecolor:red
converttomesh c1
move c1 [0,0,-5]
c1.pivot = [0,0,0]
rotate c1 90 [0,1,0]
move c1 [0,3,0]
c1.pivot = [0,0,0]
c2 = copy c1 wirecolor:blue
c2.pivot = [0,0,0]
rotate c2 120 [0,0,1]
c3 = copy c2 wirecolor:orange
c3.pivot = [0,0,0]
rotate c3 120 [0,0,1]
--
c21 = copy c1 wirecolor:red
c21.pivot = [0,0,0]
c22 = copy c1 wirecolor:blue
c22.pivot = [0,0,0]
rotate c22 120 [0,0,1]
c23 = copy c22 wirecolor:orange
c23.pivot = [0,0,0]
rotate c23 120 [0,0,1]
--
rotate c21 180 [1,0,0]
rotate c22 180 [1,0,0]
rotate c23 180 [1,0,0]
--
move c1 [0,-4,0]
move c2 [0,-4,0]
move c3 [0,-4,0]
move c21 [0,4,0]
move c22 [0,4,0]
move c23 [0,4,0]
--
dist=7
move c1 [dist,0,0]
move c2 [dist,0,0]
move c3 [dist,0,0]
move c21 [dist,0,0]
move c22 [dist,0,0]
move c23 [dist,0,0]
--
c121 = copy c1 wirecolor:red
c121.pivot = [0,0,0]
rotate c121 120 [0,0,1]
c122 = copy c2 wirecolor:blue
c122.pivot = [0,0,0]
rotate c122 120 [0,0,1]
c123 = copy c3 wirecolor:orange
c123.pivot = [0,0,0]
rotate c123 120 [0,0,1]
--
c221 = copy c21 wirecolor:red
c221.pivot = [0,0,0]
rotate c221 120 [0,0,1]
c222 = copy c22 wirecolor:blue
c222.pivot = [0,0,0]
rotate c222 120 [0,0,1]
c223 = copy c23 wirecolor:orange
c223.pivot = [0,0,0]
rotate c223 120 [0,0,1]
--
c321 = copy c1 wirecolor:red
c321.pivot = [0,0,0]
rotate c321 240 [0,0,1]
c322 = copy c2 wirecolor:blue
c322.pivot = [0,0,0]
rotate c322 240 [0,0,1]
c323 = copy c3 wirecolor:orange
c323.pivot = [0,0,0]
rotate c323 240 [0,0,1]
--
c421 = copy c21 wirecolor:red
c421.pivot = [0,0,0]
rotate c421 240 [0,0,1]
c422 = copy c22 wirecolor:blue
c422.pivot = [0,0,0]
rotate c422 240 [0,0,1]
c423 = copy c23 wirecolor:orange
c423.pivot = [0,0,0]
rotate c423 240 [0,0,1]

 

 

Теперь интересно выяснить, что известно о функциональности белков, в составе которых есть такая гиперспираль. 

 


Вот, что известно о белке, в состав которого входит эта гиперспираль:
https://www.uniprot.org/uniprot/Q54KA7

Цитата: Protein: Ankyrin repeat Molecular function: guanyl-nucleotide exchange factor activity

Цитата2: actin cytoskeleton organization 

Кушелев: Автоперевод на русский: организация актинового цитоскелета

Ну что же, неплохо для начала. Цитоскелет из трёхгранных призм очень функционален. Теперь слово за структурными биологами, которые знают о структуре этого белка из "мокрых экспериментов". 

 

Увеличить 

Если же нижняя часть призмы повёрнута на 120 градусов относительно верхней (красная грань, состоящая из альфа-спиралей переходит в голубую, состоящую из пи-спиралей), то из таких гибридных призм можно изготовить двухслойный треугольный паркет.

 

 

Второй слой будет смещён относительно первого, как четный слой кирпичной кладки относительно нечётного. Речь идёт о шестиугольниках, составленных и треугольников. Центры шестиугольников второго слоя попадут на вершины шестиугольников первого слоя. Это сделает структуру прочнее. В реальном белке три слоя, причём состоящих из более тонких слоёв. Первый слой состоит из 4 более тонких. Далее происходит смещение. Под альфа-спиралями (красный) оказываются пи-спирали (голубой). Этот второй слой в свою очередь состоит из 7 более тонких. Далее происходит второе смещение. Под пи-спиралями второго слоя (голубой) оказываются 310-спирали (оранжевый). Этот третий слой состоит из трёх более тонких. В итоге каждая грань каждой треугольной призмы состоит из спиралей трёх типов. Это значит, что параметры граней являются усреднёнными параметрами трёх типов спиралей. Это обусловливает высокую стабильность геометрии. Чем-то напоминает свойство пчелиных сот. Видимо, это очень важно для цитоскелета (скелета клетки) Symbiodinium microadriaticum.

 Обсуждение


  Лазерные системы инопланетян

 

Попробуем посмотреть на это изделие не глазами ювелира, а глазами специалиста по СВЧ технике. Мы видим последовательность диэлектрических, например, рубиновых шариков, которая сменяется чередованием "красный-белый", после чего переходит в последовательность белых шариков, которые могут иметь другой показатель преломления. Далее идёт чередование "белый-серебристый", после чего последовательность серебристых, вероятно, посеребрённых или целиком серебряных шариков. Какими свойствами обладает такая гибридная "диэлектрик-проводник" система?

Сегодня уже известно, что чередование "проводник-диэлектрик" может являться дифракционным зеркалом с коэффициентом отражения типа 0.999999. Если же чередуются диэлектрические элементы с разным показателем преломления, то это может быть полупрозрачное дифракционное зеркало, через которое энергия может поступать в какое-нибудь устройство. Например, в мазер непрерывного действия.

 Обсуждение


 Шкала Зулушки (девушки из племени Zulu).

 

Эта шкала интересна следующими особенностями. Во-первых, чередование цветов "коричневый-салатовый-коричневый" повторяется на разных масштабных уровнях, т.е. на уровне одиночных полос и на уровне полос с кратностью 4. Во-вторых, мы видим удвоение элементов шкалы. Дважды повторяется чередование с участием оранжевых полос, затем с участием широких коричневых полос. Зачем это нужно? Возможно, что ответ на этот вопрос можно получить, исследуя сигнал считывания этой шкалы...

 Обсуждение


 Музыкальный сигнал считывания геодезической шкалы Зулушки.

Unplanet music.  Alexander Kushelev.

Анти-вальс и вальс в квадрате 


Прослушивая сигнал считывания шкалы Зулушки возникает ассоциация с процессом уточнения измерений за счёт дробления делений шкалы. Известно, что наиболее точные измерения производятся методом сравнения. Возможно, что именно для этого и были удвоены подструктуры периодов в шкале Зулушки.

 Обсуждение


  Эталонный цирк

 

 Мы уже знаем, что клоуны копируют инопланетных геодезистов не столько внешним видом, но и поведением.

Подробнее

 

Но клоун - центральная фигура в цирке. И сам цирк, как мы уже убедились может выглядеть как "летающая тарелка" с геодезической шкалой:

 

 Получается, что цирковой шатёр изображает эталон с геодезической шкалой. Эталоннйый цирк :)

 Обсуждение


 Создан онлайн сервис "Определение структуры белка по нуклеотидной последовательности"

Профессиональный онлайн-сервис 

Определены структуры всех белков человека Часть 1 Часть 2


3D генетический код подтвержден методами РСА, ЯМР и КД:

 

  
   


На базе научного открытия нами создан онлайн-сервис по определению структуры белковых молекул. Теперь мы сможем зарабатывать вместе.

Презентация для заказчиков белковых структур 

По старой технологии определение одной структуры белка обходится примерно в 10 000 евро, а ждать нужно от 2 месяцев до 3 лет. По новой технологии структура определяется в 1000 раз точнее и в миллиард раз быстрее. 80% от найденного Вами заказа принадлежат Вам, как менеджеру.

Наш лозунг: "В 1000 раз лучше, в 1000^3 быстрее и в 1000 раз дешевле!"

Ваша задача заключается в размещении рекламы на онлайн-сервис белковых структур. Рынок этих структур очень большой и продолжает стремительно расти. Ежедневно кто-то оплачивает до 60 структур по средней цене 10 000 евро за штуку. Новая технология позволила на одном персональном компьютере за неделю определить структуры всех 115 000 белков человека, для которых известна нуклеотидная кодирующая последовательность. При этом качество результата, полученного по новой технологии в 1000 раз выше по точности, в миллиард раз по быстродействию и в 30 раз шире по номенклатуре белковых молекул. Единственное, что нам сегодня не хватает - рекламы.

Как получить Вашу первую зарплату менеджера? Найти заказчика белковых структур  и убедить его заказать за счёт лаборатории Наномир пробный заказ. Когда заказчик распробует новую технологию, он начнёт делать коммерческие заказы. С первого коммерческого заказа менеджер получает 80%. С последующих заказов процент будет постепенно уменьшаться, но с первого заказа другого заказчика менеджер снова получит 80%. Зарплата менеджера может достичь миллиона евро в день. И это не предел.


Фрагмент модели лизоцима, замкнувшийся через дисульфидный мостик в процессе автоматической сборки по таблице композиционного генетического кода.

https://img-fotki.yandex.ru/get/371487/158289418.4bc/0_18a588_ce47e849_orig.gif

"Монстр" первой хромосомы человека насчитывает 5207 аминокислотных остатков.

Словарь вторичных структур:


Подробнее: https://picotechnology-of-proteines.nethouse.ru/  

Вторичная структура белка (фрактальная программная спираль) в компактном изображении: 


Первая 1000 белковых структур за счёт лаборатории Наномир (по старой технологии это стоило бы 10 миллионов евро). 

 Обсуждение


Инвестирование научных проектов

 

Приглашаем инвесторов и меценатов.

Как продвинуть цивилизацию на новый уровень своего развития и получить при этом огромные прибыли?

- Вложить деньги
в научные разработки.

Новейшие виды экологически чистых и мощных источников энергии, средство для продления жизни, 
высокие технологии.

Все это реально создать в ближайший год-два при наличии достаточного финансирования.

Готовые коммерческие продукты

1. Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY

2. Сверхдобротные одномодовые диэлектрические резонаторы в т.ч. с большим диапазоном перестройки

3. Станки для производства высокодобротных одномодовых резонаторов 

4. Технология изготовления сапфировых линз 

5. Магнитный тороидально-сферический конструктор

Проекты

01 Ruby Emdrive (Микроволновый двигатель без реактивной струи)

02 Ruby Power Source (Микроволновый источник энергии) 

03 Средство продления жизни (Возвращение молодости)

04 Октаэдрический редуктор

05 Шестеренчатая передача Кушелева

06 Магнитный подвес-стыковка-герметизация модулей

07 Ионно-микроволновый фрактальный излучатель

08 Гибкий отражатель из жестких элементов

09 Энциклопедия "Наномир"

10 Экспертиза

11 Конструктивные компьютерные игры

12 Интеллектуальный кодовый замок

13 Очки кругового обзора

14 Тетраэдрический сканер

15 Программируемая архитектура

16 Источник энергии промышленной частоты

17 Источник энергии постоянного тока

18 Монокристаллическая видеокамера

19 Система определения активных участков белка

20 Тераваттный лазер непрерывного действия

21 Бактериальный синтез алмазов

22 Шестеренчатые передачи с тремя степенями свободы

23 Сверхсветовая связь

24 Безосевая шестеренчатая передача

25 Aктивный язык программирования

26 Телевидение миллиметрового и оптического диапазонов

27 Микроволновая архитектура

28 Компьютерный экран из автономных элементов

29 Чтение / запись ДНК

30 Сверхсветовая локация / зрение

31 Нейтрализатор акустического сигнала

Коммерческое предложение: 

Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.

Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).

В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка. 

Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.

Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структуре Вашего белка.

 Сотрудничество может быть различным:

- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)

- совместное создание коммерческого продукта

- поиск инвесторов

- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов 

- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир

- содействие в проведении экспериментов и т.п.

- написание совместных научных статей и т.п.

- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)

 

Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир.

+7-926-5101703  +7-903-2003424, mail: kushelev20120@yandex.ru

Карта VISA Сбербанка  4276400045661130

PayPal: kushelev20120@yandex.ru (вариант перевода друзьям) 

веб-мани: WM-кошелек R426964799301

Кошелек Яндекс-деньги: 410011905885672 

Огромное спасибо всем за помощь и поддержку!    



В избранное