Новости лаборатории Наномир

  Все выпуски  

867 Определены структуры всех белков вируса обезьяньей оспы!


Выпуск 867

Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

 Определены структуры всех белков вируса

обезьяньей оспы!

Перед нами так называемый "голубой" геном, как и в случае с коронавирусом. Большинство спиральных участков представляют собой пи-спирали (синий). 

0171-URK20610-1-P-0-b1

Одним из интересных белков вируса обезьяньей оспы является белок с идентификатором URK20610.1, в структуре которого присутствует фрактальная 78-спираль. В этой программной спирали DSDTDTDTDTDTDTDTDTDVE чередуются одиночные коды бета-(салатовый) и пи-(голубой) спиралей.

 0001-URK20440-1-P-0-b1

0002-URK20441-1-P-0-b1

0003-URK20442-1-P-0-b1

0004-URK20443-1-P-0-b1

0005-URK20444-1-P-0-b1

0006-URK20445-1-P-0-b1

0007-URK20446-1-P-0-b1

0008-URK20447-1-P-0-b1

0009-URK20448-1-P-0-b1

0010-URK20449-1-P-0-b1

0011-URK20450-1-P-0-b1

0012-URK20451-1-P-0-b1

0013-URK20452-1-P-0-b1

0014-URK20453-1-P-0-b1

0015-URK20454-1-P-0-b1

0016-URK20455-1-P-0-b1

0017-URK20456-1-P-0-b1

0018-URK20457-1-P-0-b1

0019-URK20458-1-P-0-b1

0020-URK20459-1-P-0-b1

0021-URK20460-1-P-0-b1

0022-URK20461-1-P-0-b1

0023-URK20462-1-P-0-b1

В структуре этого белка видна фрактальная 57- или Q-спираль Кушелева. В Q-спирали KSKQLKSFLSSK (длина 12 аминокислотных остатков) чередуются одиночные коды альфа-(розовый) и пи-(голубой) спиралей.

0024-URK20463-1-P-0-b1

0025-URK20464-1-P-0-b1

0026-URK20465-1-P-0-b1

0027-URK20466-1-P-0-b1

0028-URK20467-1-P-0-b1

0029-URK20468-1-P-0-b1

0030-URK20469-1-P-0-b1

В этом белке мы видим два участка фрактально 778-спирали (одиночные коды пи- (голубой) и бета- (салатовый) спиралей. Первый участок FNVNTGDRIA длиной 10 аминокислотных остатков и второй участок EEVQSLDSTDRGDQ длиной 14 аминокислотных остатков.

0031-URK20470-1-P-0-b1

0032-URK20471-1-P-0-b1

0033-URK20472-1-P-0-b1

0034-URK20473-1-P-0-b1

0035-URK20474-1-P-0-b1

0036-URK20475-1-P-0-b1

0037-URK20476-1-P-0-b1

0038-URK20477-1-P-0-b1

0039-URK20478-1-P-0-b1

0040-URK20479-1-P-0-b1

0041-URK20480-1-P-0-b1

0042-URK20481-1-P-0-b1

0043-URK20482-1-P-0-b1

0044-URK20483-1-P-0-b1

0045-URK20484-1-P-0-b1

0046-URK20485-1-P-0-b1

0047-URK20486-1-P-0-b1

0048-URK20487-1-P-0-b1

0049-URK20488-1-P-0-b1

0050-URK20489-1-P-0-b1

0051-URK20490-1-P-0-b1

0052-URK20491-1-P-0-b1

0053-URK20492-1-P-0-b1

0054-URK20493-1-P-0-b1

0055-URK20494-1-P-0-b1

0056-URK20495-1-P-0-b1

0057-URK20496-1-P-0-b1

0058-URK20497-1-P-0-b1

0059-URK20498-1-P-0-b1

0060-URK20499-1-P-0-b1

0061-URK20500-1-P-0-b1

0062-URK20501-1-P-0-b1

0063-URK20502-1-P-0-b1

0064-URK20503-1-P-0-b1

0065-URK20504-1-P-0-b1

0066-URK20505-1-P-0-b1

0067-URK20506-1-P-0-b1

0068-URK20507-1-P-0-b1

0069-URK20508-1-P-0-b1

0070-URK20509-1-P-0-b1

0071-URK20510-1-P-0-b1

0072-URK20511-1-P-0-b1

0073-URK20512-1-P-0-b1

0074-URK20513-1-P-0-b1

0075-URK20514-1-P-0-b1

0076-URK20515-1-P-0-b1

0077-URK20516-1-P-0-b1

0078-URK20517-1-P-0-b1

0079-URK20518-1-P-0-b1

0080-URK20519-1-P-0-b1

0081-URK20520-1-P-0-b1

0082-URK20521-1-P-0-b1

0083-URK20522-1-P-0-b1

0084-URK20523-1-P-0-b1

0085-URK20524-1-P-0-b1

0086-URK20525-1-P-0-b1

0087-URK20526-1-P-0-b1

0088-URK20527-1-P-0-b1

0089-URK20528-1-P-0-b1

0090-URK20529-1-P-0-b1

0091-URK20530-1-P-0-b1

0092-URK20531-1-P-0-b1

0093-URK20532-1-P-0-b1

0094-URK20533-1-P-0-b1

0095-URK20534-1-P-0-b1

0096-URK20535-1-P-0-b1

0097-URK20536-1-P-0-b1

0098-URK20537-1-P-0-b1

0099-URK20538-1-P-0-b1

0100-URK20539-1-P-0-b1

0101-URK20540-1-P-0-b1

0102-URK20541-1-P-0-b1

0103-URK20542-1-P-0-b1

0104-URK20543-1-P-0-b1

0105-URK20544-1-P-0-b1

0106-URK20545-1-P-0-b1

0107-URK20546-1-P-0-b1

0108-URK20547-1-P-0-b1

0109-URK20548-1-P-0-b1

0110-URK20549-1-P-0-b1

0111-URK20550-1-P-0-b1

0112-URK20551-1-P-0-b1

0113-URK20552-1-P-0-b1

0114-URK20553-1-P-0-b1

0115-URK20554-1-P-0-b1

0116-URK20555-1-P-0-b1

0117-URK20556-1-P-0-b1

0118-URK20557-1-P-0-b1

0119-URK20558-1-P-0-b1

0120-URK20559-1-P-0-b1

0121-URK20560-1-P-0-b1

0122-URK20561-1-P-0-b1

0123-URK20562-1-P-0-b1

0124-URK20563-1-P-0-b1

0125-URK20564-1-P-0-b1

0126-URK20565-1-P-0-b1

0127-URK20566-1-P-0-b1

0128-URK20567-1-P-0-b1

0129-URK20568-1-P-0-b1

0130-URK20569-1-P-0-b1

0131-URK20570-1-P-0-b1

0132-URK20571-1-P-0-b1

0133-URK20572-1-P-0-b1

0134-URK20573-1-P-0-b1

0135-URK20574-1-P-0-b1

0136-URK20575-1-P-0-b1

0137-URK20576-1-P-0-b1

0138-URK20577-1-P-0-b1

0139-URK20578-1-P-0-b1

0140-URK20579-1-P-0-b1

0141-URK20580-1-P-0-b1

0142-URK20581-1-P-0-b1

0143-URK20582-1-P-0-b1

Длина пи-спирали (синий) достигает 15 аминокислотных остатков

0144-URK20583-1-P-0-b1

0145-URK20584-1-P-0-b1

0146-URK20585-1-P-0-b1

0147-URK20586-1-P-0-b1

0148-URK20587-1-P-0-b1

0149-URK20588-1-P-0-b1

0150-URK20589-1-P-0-b1

0151-URK20590-1-P-0-b1

0152-URK20591-1-P-0-b1

0153-URK20592-1-P-0-b1

0154-URK20593-1-P-0-b1

0155-URK20594-1-P-0-b1

0156-URK20595-1-P-0-b1

0157-URK20596-1-P-0-b1

0158-URK20597-1-P-0-b1

0159-URK20598-1-P-0-b1

0160-URK20599-1-P-0-b1

0161-URK20600-1-P-0-b1

0162-URK20601-1-P-0-b1

0163-URK20602-1-P-0-b1

0164-URK20603-1-P-0-b1

0165-URK20604-1-P-0-b1

0166-URK20605-1-P-0-b1

0167-URK20606-1-P-0-b1

0168-URK20607-1-P-0-b1

0169-URK20608-1-P-0-b1

0170-URK20609-1-P-0-b1

0171-URK20610-1-P-0-b1

Здесь присутствует фрактальная 78-спираль. В этой программной спирали DSDTDTDTDTDTDTDTDTDVE чередуются одиночные коды бета-(салатовый) и пи-(голубой) спиралей.

0172-URK20611-1-P-0-b1

0173-URK20612-1-P-0-b1

0174-URK20613-1-P-0-b1

0175-URK20614-1-P-0-b1

0176-URK20615-1-P-0-b1

0177-URK20616-1-P-0-b1

0178-URK20617-1-P-0-b1

Длина пи-спирали (синий) достигает 17 аминокислотных остатков.

0179-URK20618-1-P-0-b1

0180-URK20619-1-P-0-b1

0181-URK20620-1-P-0-b1

0182-URK20621-1-P-0-b1

0182-URK20621-1-P-0-b2

0183-URK20622-1-P-0-b1

0184-URK20623-1-P-0-b1

0185-URK20624-1-P-0-b1

0186-URK20625-1-P-0-b1

0187-URK20626-1-P-0-b1

0188-URK20627-1-P-0-b1

0189-URK20628-1-P-0-b1

0190-URK20629-1-P-0-b1

Каждый желающий может заказать в лаборатории Наномир не только вторичные структуры белков, но и 3D-структуры в стандарте PDB. Часть 3D структур можно построить автоматически, т.е. с помощью программы Пикотех 3D, а часть лишь вручную.

Обратная связь: kushelev20120@yandex.ru 

Шедевры белковой архитектуры

Часть 21 

0001-KAH0805342-1-P-0-b1

 

0001-KAH0805342-1-P-0-b2

Фрактальная квази спираль. Период 5

0001-KAI4788176-1-P-0-b1

Фрактальная спираль. Период 5. "Мерцающий фрактал"

0001-KAI4898023-1-P-0-b1

Фрактальная спираль. Период 10

0002-KAG0719120-1-P-0-b1

Фрактальная спираль. Период 22

0002-KAH0806732-1-P-0-b1

0002-KAH0806732-1-P-0-b2

Период 5

0004-KAG0719122-1-P-0-b1

Период 14

0005-KAG0719123-1-P-0-b1

Период 10

0008-TNN37383-1-P-0-b1

"Мерцающий фрактал". Период 10

0009-TNN37382-1-P-0-b1

Альфа-спираль (красный) с изломами

0040-KAH0788876-1-P-0-b1

Фрактальные спирали переходят одна в другую с сохранением периода 5.

KAH0792017-P-0-b1

Фрактальные спирали переходят одна в другую с сохранением периода 5.

KAH0798071-P-0-b1

KAH0798071-P-0-b2

Фрактальные спирали переходят одна в другую с сохранением периода 5.

KAH0799489-P-0-b1

KAH0799489-P-0-b2

Фрактальные спирали переходят одна в другую с сохранением периода 5.

KAH0802395-P-0-b1

KAH0802395-P-0-b2

Фрактальные спирали переходят одна в другую с сохранением периода 5.

XM-006820011-P-0-b1

Период 10

XM-036966337-P-0-b1

Период 15

XM-036969641-P-0-b1

"Мерцающий фрактал". Период 5

XM-038822122-P-0-b1

Фрактальные спирали переходят одна в другую с сохранением периода 5.

XM-045725002-P-0-b1

Блочная структура, которая могла получиться в результате эволюции фрактальной спирали с периодом 5.

XM-045730332-P-0-b1

"Мерцающий фрактал" с периодом 10.

Фрактальная спираль с периодом 5 переходит во фрактальную спираль с периодом 20

XM-045734952-P-0-b1

Период 10

XM-045739845-P-0-b1

Период 10

XM-045740938-P-0-b1

"Мерцающий фрактал" с периодом 5

XM-045745181-P-0-b1

Переход фрактальных спиралей с сохранением периода 5.

XM-045746104-P-0-b1

Период 10.

 

XM-045746154-P-0-b1

Сверхдлинная альфа-спираль переходит во фрактальную спираль с периодом 6

XM-047616981-P-0-b1

Переход фрактальных спиралей с сохранением периода 5.

XP-028326251-P-0-b1

"Мерцающий фрактал"

XP-033646429-P-0-b1

Фрактальная спираль  на основе пи-спиральных участков (синий) с пролиновой юстировкой (желтый). Малый период 10

XP-035986995-P-0-b1

Переход фрактальных спиралей с сохранением периода 6.

Фрактальные с спирали белков помогут уточнить параметры переходов, в частности, двугранные углы между фундаментальными (альфа-310-бета-пи-Met-) спиралями. Это в свою очередь поможет настроить 3D модуль программы Пикотех и начать определять 3D структуры белков по табличной функции. Точно и быстро.

Ждём менеджеров и инвесторов для внедрения пикотехнологии и создания новых, более совершенных версий программы Пикотех.  

Обратная связь: kushelev20120@yandex.ru


 


В избранное