В ходе проверки налоговый орган счел, что общество неправомерно уменьшило облагаемую налогом на прибыль базу в связи с включением в состав расходов потерь при возврате билета в связи с изменением сроков командировки, со ссылкой на то, что эти затраты не включены в перечень расходов, учитываемых в целях налогообложения в соответствии с подп. 12 п. 1 ст. 264 НК РФ. Обществу доначислен налог на прибыль, пени и штраф по ст. 122 НК РФ.

Осуществляя брокерское обслуживание, банк выплачивал инвесторам - физическим лицам купонный доход по облигациям эмитентами которых являлись другие организации. В ходе проверки налоговый орган счел, что банк должен был удержать и перечислить в бюджет НДФЛ с выплаченного купонного дохода.

В ходе проверки банка налоговый орган счел, что оформление карточек с образцами подписей и оттиска печати не входит в перечень банковских операций, , не подлежащих обложению НДС, перечисленных в подп. 3 п. 3 ст. 149 НК РФ. По результатам проверки банку доначислен НДС, пени и штраф по ст. 122 НК РФ за неуплату данного налога.

В ходе проверки налоговый орган доначислил банку НДС, придя к выводу, что выдача банком чековых книжек своим клиентам должна рассматриваться как безвозмездная передача товара.

Предпринимателем производилась оплата в натуральном выражении (отруби, масло растительное, гречка, пшено, мука, ячневая крупа, макаронные изделия) в счет оплаты арендной платы за земельные доли. Налоговый орган посчитал передачу указанных продуктов реализацией, доначислив предпринимателю НДС.

Обжалуя в судебном порядке решение налогового органа о привлечении к налоговой ответственности, организация заявила требование о снижении размера наложенного на нее штрафа, ссылаясь на наличие смягчающих ответственность обстоятельств. Налоговый орган возразил, поскольку смягчающие обстоятельства уже были учтены при вынесении оспариваемого решения и размер налоговых санкций снижен инспекцией в два раза.

В ходе проверки организации налоговый орган выявил производство неучтенной продукции. В отношении этой продукции организации доначислены налог на прибыль и НДС расчетным путем.

Налоговый орган счел, что представленные ему платежные квитанции не являются допустимыми доказательствами уплаты налога обществом, поскольку согласно этим документам наличные денежные средства внесены не обществом, а его директором. Поскольку задолженность организации по обязательным платежам в бюджет в совокупности составила более 100 тыс. рублей и указанные требования не исполнены в течение трех месяцев с даты, когда они должны были быть исполнены, налоговый орган обратился в арбитражный суд с заявлением о признании общества несостоятельным (банкротом).

В ходе выездной проверки налоговый орган счел неправомерным применение предпринимателем упрощенной системы налогообложения в течение двух лет в связи с тем, что предприниматель не подал в установленном порядке заявление о применении данного спецрежима (п. 2 ст. 346.13 НК РФ). По результатам проверки предпринимателю доначислены налоги по общей системе налогообложения.

По результатам выездной налоговой проверки налоговым органом принято решение о привлечении налогоплательщика к ответственности за совершение налогового правонарушения. Впоследствии налоговый орган внес изменения в указанное решение, сославшись на техническую ошибку при расчете суммы налога, подлежащей уплате в бюджет. Налогоплательщику дополнительно начислен налог к уплате по сравнению с первоначальным решением.