Всемирная Организация Здравоохранения собирает экстренное совещание для обсуждения угрозы нового штамма SARS-CoV-2, который совсем недавно был обнаружен в Ботсване и ЮАР, но уже появился в Египте, Израиле и Бельгии. Опять государства одно за другим вводят ограничения на международные сообщения. Ученые пытаются понять, как многочисленные мутации S-белка, характерные для варианта B.1.1.529, повлияют на его вирулентность и на иммунный ответ организма. Но что вообще означает эта комбинация, похожая на код от сейфа?

Благодаря всеобщим усилиям и простоте современного секвенирования (а также удивительной распространенности и изменчивости самого коронавируса) за время пандемии удалось идентифицировать десятки тысяч его разновидностей. Уже к лету 2020 г. их было более 35 тыс., и тогда же британские биологи предложили для SARS-CoV-2 «динамическую» номенклатуру Pango, на основе которой можно давать формальное название каждому новому обнаруженному варианту. Это не единственная номенклатура коронавирусов SARS-CoV-2, однако используется она шире других. Видя такой код, специалист сразу может в общих чертах понять предысторию и особенности очередной разновидности коронавируса.

Согласно правилам, описанным в журнале Nature Microbiology, первой в названии должна стоять буква латинского алфавита, которая относит вариант к тому или иному «первопредку». Линии А и В были обнаружены еще в Ухане, причем В – аж в декабре 2019 г., А – чуть позже, в январе 2020-го. Однако в геноме варианта А присутствует пара нуклеотидов, которые имеются еще у коронавирусов летучих мышей, а у В их нет. Поэтому можно предположить, что линия А возникла раньше, до того, как произошла мутация в этих двух участках, и лишь по случайности была идентифицирована второй. Именно она и получила первую . . . Читать дальше