Tom & Jerry 3 — игра в жанре платформер. В некоторых уровнях можно играть за Джерри, в некоторых — за Тома. Оружием героев являются шарики (у каждого из персонажей они своего цвета), которыми достаточно тяжело попасть по противникам. Главным боссом является ведьма, победить которую должен мышонок Джерри.