Счет-фактура играет важнейшую роль при расчетах по налогу на добавленную стоимость. Существующий в настоящее время "зачетный" механизм исчисления НДС ставит возможность применения вычета (возмещения) в прямую зависимость от наличия надлежащим образом оформленного счета-фактуры.
Согласно п. 1 ст. 169 НК РФ счет-фактура является документом, служащим основанием для принятия покупателем предъявленных продавцом товаров (работ, услуг), имущественных прав (включая комиссионера, агента, которые осуществляют реализацию товаров (работ, услуг), имущественных прав от своего имени) сумм налога на добавленную стоимость к вычету.