Отправляет email-рассылки с помощью сервиса Sendsay

Новости лаборатории Наномир

  Все выпуски  

582 Пикотехнологический метод датировки


Выпуск 582

Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

 Пикотехнологический метод датировки

Среди нуклеотидных кодирующих белки последовательностей обнаружились "вымершие", т.е. потерявшие актуальность на разных этапах эволюции. Вот пример одного из таких генетических кодов:

https://img-fotki.yandex.ru/get/57797/158289418.3b3/0_16f5fa_44507f09_XL.gif

https://img-fotki.yandex.ru/get/48069/158289418.3af/0_16ee92_bc86a07b_orig.gif 

На базе подобных нуклеотидных последовательностей можно датировать организмы, в т.ч. ископаемые, т.е. жившие на нашей планете несколько миллиардов лет тому назад.

Пикотехнологический метод датировки может существенно дополнить другие, например, изотопные методы датировки, увеличивая точность и надёжность датировки, например, пластов горных пород, содержащих древние микроорганизмы. 

 Обсуждение


Тайна трёх стоп-кодонов

 

Я давно ломал голову, зачем целых три стоп-кодона? Типа: "Финиш", "конец пути" и "стоп". Какой смысл использовать целых три синонима для остановки трансляции?

Сегодня на этот вопрос неожиданно нашёлся ответ.

В процессе эволюции одна и та же нуклеотидная последовательность стала использоваться для синтеза трёх белков. При этом эти белки часто обладают рекордными параметрами! Например,

 

https://img-fotki.yandex.ru/get/170815/158289418.3b3/0_16f5f8_4b506400_XL.png
Нуклеотидная последовательность без сдвига кодирует прямую альфа-спираль длиной 28 ао. Вероятность случайного повторения 28 композиционных кодов "1" = 4^-28 = 2^-56
https://img-fotki.yandex.ru/get/195559/158289418.3b3/0_16f5f9_236703e0_XL.gif
Нуклеотидная последовательность со сдвигом 1 кодирует повторяющийся фрагмент белка 3UAO.

Нуклеотидная последовательность со сдвигом на 2 позиции кодирует фрагмент необычного кольца:

https://img-fotki.yandex.ru/get/57797/158289418.3b3/0_16f5fa_44507f09_XL.gif

 https://img-fotki.yandex.ru/get/48069/158289418.3af/0_16ee92_bc86a07b_orig.gif

 Обсуждение


 Как выглядит архитектурный нео-квази-перевертыш?

 

Обычный архитектурный перевёртыш - это два антипараллельных, точнее эквидистантных участка белковой молекулы. Например, впереди идёт участок крупной правой спирали, потом поворачивает на 180 градусов и возвращается по той же правой спирали, образуя водородные связи вдоль всего антипараллельного участка.

3D структура нео-перевертыша может напоминать структуру нуклона или мезона, состоящего из кварков. "Туда идёт, например, несколько витков правой спирали, а обратно возвращается столько же витков левой. Водородные (или другие) связи соединяют их между собой на каждом витке. Учитывая, что витки могут быть не круглые, а, например, треугольного или другого сечения, связи на каждом витке могут быть множественными.

Увидеть, как оно на самом деле, поможет 3D-модель нео-перевертыша. Подробнее

 

Подробнее

 Обсуждение


 Анатомия диссонансных архитектурных перевертышей

 https://img-fotki.yandex.ru/get/196486/158289418.3ad/0_16ec36_88d390be_orig.png

Легкий диссонанс

 Если симметрия структуры слегка нарушена, то получается не резонанс, а легкий диссонанс, т.е. "почти резонанс". Зачем это нужно? В случае точного резонанса фазы внешнего процесса и процесса в резонаторе совпадают. Если же наблюдается легкий диссонанс, то фазы отличаются. Сдвиг фаз приводит к появлению нескомпенсированной силы, которая вызывает ускорение резонатора в среде. Именно дистанционное управление молекулами и является свойством биологически активных центров белковых молекул. Если же активный центр белковой молекулы является "лёгким диссонансом", что можно заметить на уровне вторичной структуры, то такой активный центр может  перемещать нужную молекулу из пункта отправления, где сдвиг фаз отличен от нуля в пункт назначения, где сдвиг фаз нулевой. 

 Обсуждение


 РСА не может надежно определить даже тип белка!

Материал с форума лаборатории Наномир:

Виктория Соколик: Всё не настолько печально, как декларирует Александр Юрьевич только потому, что эксперимент не совпадает с результатами его программы. 

Кушелев: Уважаемая Виктория! Разве Вы не видите, что РСА не позволяет надёжно определить даже тип белка? Ваша программа тоже показывает альфа-спирали, которые "не видит" РСА smile

http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore … ureId=5LPF

https://img-fotki.yandex.ru/get/228104/158289418.3b6/0_16f9f9_559c74b0_XL.png

РСА показывает, что в этом белке преобладают не спиральные участки. 

По таблице композиционного генетического кода мы видим именно спирали: 

https://img-fotki.yandex.ru/get/198613/158289418.3b6/0_16f9f8_40906669_XL.gif

РСА может показать альфа-спирали там, где их нет: http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore … ureId=5H2V

https://img-fotki.yandex.ru/get/58454/158289418.3b5/0_16f957_49f72876_XL.png

По данным РСА этот белок состоит практически только из альфа-спиралей

По таблице композиционного генетического кода альфаспиралей в этом белке нет: 

https://img-fotki.yandex.ru/get/172272/158289418.3b5/0_16f955_edc52dae_orig.png

Вторичная структура полностью

Таблица композиционного генетического кода составлялась на основе качественных данных, полученных с помощью нескольких независимых методов: РСА, ЯМР и др. Массовый РСА потерял качество, а композиционный генетический код всегда имеет 100%-ное качество :) 

 Обсуждение


 Найди иголку в стоге сена размером с планету...

 https://img-fotki.yandex.ru/get/195786/158289418.3ac/0_16ebde_3ea398ad_orig.gif

Вероятность случайного композиционного кода этого белка такая же, как выпадение "орла" 76 раз подряд. Примерно такая же вероятность с первой попытки обнаружить иголку в стоге сена, размером с Солнце. Это говорит о том, что таблица композиционного генетического кода составлена без ошибок. Случайность исключена.

 

Подробнее

Обсуждение


Уважаемые коллеги! Все, кто помогает создавать пикотехнологию, рубиновую энергетику, поднимает нашу цивилизацию на новую ступень развития. Всех нас можно поздравить с крупным успехом. Эксперименты в США, Германии и в Израиле подтвердили, что мы находимся на верном пути по трём главным научным направлениям лаборатории Наномир.

По теме "Рубиновая/микроволновая энергетика и транспорт" осталось сделать последний шаг, включить готовые источники энергии. Конечно, с помощью магнетрона миллиметрового диапазона создать рубиновую энергетику можно за считанные дни, но для этого нужно доделать номинальный ряд эллипсоидов и рубиновый энергетический конструктор.

Спасибо за поддержку! 

 

Что нужно лаборатории для ближайших исследований:

Skype, 2016-04-25:

[12:51:45] Jocie Lee: Now we have round shape . the maximum size is 11mm

 

 

[13:26:01] Jocie Lee: The price is 773 usd/pcs

[13:30:11] Кушелев Александр Юрьевич: Thank You very mach!

[13:31:24] Кушелев Александр Юрьевич: Do You have diamond box (color, for example yellow) 4x4x1mm ? If Yes, need price... 

[13:33:50] Кушелев Александр Юрьевич: And I need this forms:

  

[13:59:46] Jocie Lee: oh...I am sorry. We dont sell box

[14:02:33] Кушелев Александр Юрьевич: OK! I wait money from my investors. I need 773usd/pcs diamond.

[14:02:49] Jocie Lee: OK

[14:03:13] Кушелев Александр Юрьевич: Do You make color diamonds?

[14:04:50] Jocie Lee: I think this colorful stone is cubic zirconia

[14:05:23] Кушелев Александр Юрьевич: But I need color synthetic diamonds for science experiments :)

[14:06:50] Кушелев Александр Юрьевич: I have cubic zirconia, but it has bad electromagnetic parameters. I need color synthetic diamond only. Your diamond size is very good!

1. Заказать алмазный энергетический конструктор. Минимальный заказ 773 USD + EMS доставка. 

2. Оплатить покупку или аренду измерительной аппаратуры на диапазон от 4 до 32 ГГц. (От $1000). Идеальный вариант: http://www.keysight.com/en/pd-460865-pn-E8257D/psg-analog-signal-generator?&cc=RU&lc=rus

3. Начать третий этап создания средства для продления жизни: http://nanoworld.org.ru/topic/818/

Книга "Пикотехнология белков" уже в продаже!

Подробности


Менеджеры, которые найдут заказы на структуры белков, получат 80% от суммы заказа! 

 Приглашение к сотрудничеству

Лаборатория "Наномир" готова к взаимовыгодному сотрудничеству. 

В одиночку внедрить технологии, выводящие цивилизацию на новый уровень,  невозможно. Благодаря поддержке множества заинтересованных людей проделана огромная работа. Ознакомиться с её результатами можно изучив материал рассылки "Новости лаборатории Наномир". Люди науки могут изучить научные труды.

Вклад каждого не останется незамеченным в случае успеха в реализации научных проектов. Результаты совместной деятельности принадлежат участникам проекта пропорционально коэффициентам творческого и финансового участия.

Основные разработки: 

 Микроволновый источник энергии

Работы по созданию новой энергетики (микроволновой) ведутся с 1992 года.

В 2011 году были куплены рубиновые шарики для эксперимента на сумму ~1000 долл. Был проведен первый эксперимент в Дубне. В результате было сделано научное открытие, проверена защита диэлектрических резонаторов от перенапряжения. В марте 2016 года проведен первый этап эксперимента в микроволновой печи. Цель эксперимента - включение рубинового генератора. На первом этапе удалось возбудить рубиновый резонатор до уровня поверхностного пробоя, т.е. до напряжённости 1000 000 вольт на метр. Цель следующего этапа - заставить рубин светиться.

 

 

Для завершающего этапа исследований по созданию микроволновой энергетики не хватает номинального ряда рубиновых резонаторов, который может быть изготовлен на китайской фабрике. Это стоит на порядок дешевле, чем качественная измерительная аппаратура миллиметрового диапазона.

  "Регенерация репродуктивного возраста"

28 сентября 2011г. в Институте геронтологии (г.Киев) начался эксперимент по созданию "Регенератора репродуктивного возраста". В 2012-ом году мы уже знали, как омолодить лабораторных животных. Это было описано в 281-ом выпуске рассылки "Новости лаборатории Наномир. "Прожиточный минимум вампира"

В 2014-ом году американские ученые смогли реализовать этот вариант омоложения. Тем не менее мы ещё можем успеть первыми создать дешевый регенератор, возвращающий молодость, но для этого необходимо закупить праймеры для идентификации сигналов отключения феноптоза (механизма старения), как это делает эмбрион во время беременности. Если омоложение по-американски обойдётся заказчику в 250-500 долл. ежедневно, то дешёвый вариант омоложения будет стоить всего 20-30 копеек в день.

Программа исследований Презентация Обсуждение

  Пикотехнология 

Созданы первые версии пикотехнологии (выпуски рассылки 212 270 271 272 ), с помощью которой Александр Кушелев и Виктория Соколик сделали более10 научных открытий. Подготовлена к печати монография "Пикотехнология белков".

Виктория Соколик: Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.

Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).

В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка. 

Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.

Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структурном шаблоне Вашего белка.

Определены две структуры белка (пробный заказ) для Испанского заказчика.

В книге "Пикотехнология белков" приведены примеры 100 белковых структур

Цена  заказов -- договорная. 

 Сотрудничество может быть различным:

- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)

- совместное создание коммерческого продукта

- поиск инвесторов

- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов 

- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир

- содействие в проведении экспериментов и т.п.

- написание совместных научных статей и т.п.

- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)

 

Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир.

+7-926-5101703  +7-903-2003424 +7-916-8265031, Skype: Kushelev2009, mail: kushelev20120@yandex.ru

веб-мани: WM-кошелек R426964799301 Другие способы перевода


В избранное