Новости лаборатории Наномир

  Все выпуски  

Программный аналог бета спирали и складчастого бета-слоя.


Выпуск 310

 Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

Программный аналог бета-спирали и складчастого бета-слоя.

3212-спираль, в которой регулярно повторяется фрагмент композиционного кода 3212, напоминает бета-спираль, только имеет пятиричную квазисимметрию, как и семеричная спираль.

http://img-fotki.yandex.ru/get/6311/158289418.1/0_7da25_d7edb744_L.jpg

Сбоку видны характерные ~прямые углы, как и в бета-спирали. 

 

http://img-fotki.yandex.ru/get/6112/158289418.1/0_7da37_a13a54f7_L.jpg

Эта конструкция напоминает складчатый бета-слой. Композиционный код: 13323133231

http://img-fotki.yandex.ru/get/6213/158289418.1/0_7da3b_69cc7971_S.gif

 Обсуждение.


 Программная спираль с восмеричной квазисимметрией.

Любопытный повтор композиционного кода: 23323323 ... Интересно посмотреть на него в 3D... 

http://img-fotki.yandex.ru/get/6113/158289418.1/0_7da3c_a0009b25_L.jpg
http://img-fotki.yandex.ru/get/6113/158289418.1/0_7da3e_a22ac74_L.gif 

Поворот до совмещения с соседним аминокислотным остатком происходит на 45 градусов, значит спираль имеет 8-ричную квазисимметрию. 

Кушелев: В структуре белка используется ряд подструктур, похожих на базовые, но построенных по микропрограммам. Это позволяет уточнить интерпретацию экспериментальных данных из Protein Data Base, а в ряде случаев заменить неправильную интерпретацию на правильную. 

Обсуждение 


 Пикотехнологические модели на конкурс белков CASP10

с 691 по 708 (по два вида, смотреть через зеркало)

    

 

    
T0691                        T0692                        T0693                       T0694                       T0695
 


T0696

 

T0697

    

    

T0698                    T0699                        T0700                         T0701                      T0702

 
T0703

    

    

T0704                       T0705                    T0706                      T0707                       T0708

T0706 (fragment)

Обсуждение. 


Пикотехнология помогает визуально обнаружить активные центры белка! 

Рассмотрим более внимательно структуру конкурсного белка T0691:

http://img-fotki.yandex.ru/get/6310/158289418.2/0_7dd27_1e6ca75f_orig.png

Обратите внимание на расположение радикалов триптофана (квадратный 3х3) и тирозина (бензольное кольцо с группой OH) на переднем плане.

http://img-fotki.yandex.ru/get/6213/158289418.2/0_7dd26_286fc5c7_L.gif

На заднем плане за радикалом триптофана тоже виден какой-то радикал. Всё это напоминает типовую структуру активного центра с резонансной системой.

http://img-fotki.yandex.ru/get/6113/158289418.2/0_7dd28_17d27d29_orig.png

Материал с форума лаборатории Наномир: 

diprospan: да, и подтверждается тем, что совпадает дипольный момент:

http://s1.bild.me/bilder/160512/3237204t0691-pdb-dipoln-moment.jpg

Кушелев: Вы не могли бы дать более развёрнутый комментарий? Что за момент, с чем совпадает, откуда это видно? 

http://img-fotki.yandex.ru/get/6312/158289418.2/0_7dd34_c3c00f0e_orig.png

В белке T0692 тоже обнаружился любопытный фрагмент, характерный для активных центров белка... 

http://img-fotki.yandex.ru/get/6112/158289418.2/0_7dd35_7e0bed4c_L.png

 Наличие цикличного участка белка T0694, вероятно, можно проверить экспериментально. 

Кушелев: И что с чем совпадает? 

diprospan: активный центр белка пожалуй лучшее ваше определение в этом векторе.

Кушелев: Вы хотите сказать, что активный центр попадает в зону максимальной напряжённости электрического поля? Такое совпадение действительно вряд ли случайно...

http://s1.bild.me/bilder/160512/3237204t0691-pdb-dipoln-moment.jpg

Поле ориентирует некую полярную молекулу, после чего её обрабатывают на триптофановой наковальне в резонансном(?) режиме smile 

http://img-fotki.yandex.ru/get/6313/158289418.2/0_7dd42_69d380f6_L.gif

Любопытная структура у белка T0691 ...

Вторичная структура фактически замыкается. Изображение получено в браузере Avogadro

http://img-fotki.yandex.ru/get/6313/158289418.2/0_7dd4b_d6378e77_L.png

 

http://img-fotki.yandex.ru/get/6313/158289418.2/0_7dd57_b8926525_L.gif

Любопытная структура белка T0697. Возможно, что спираль гнется на пролинах и образует некий реберный многогранник... 

http://img-fotki.yandex.ru/get/6312/158289418.2/0_7dd5d_7eb3d9d3_L.png

T0692, Trp467

Кушелев: Согласитесь, что таких совпадений не бывает... 

 Обсуждение.


Вести c ускорителей и не только!

 

http://img-fotki.yandex.ru/get/6313/158289418.2/0_7de67_8adf87f6_L.jpg
К эксперименту в г.Орле готовится рубиновый генератор (пока резонатор), состоящий из 4 рубиновых шариков производства Meller Optics диаметром ~4760 мкм.
http://img-fotki.yandex.ru/get/51/158289418.3/0_7de68_4927e639_L.jpg
Первый рубиновый шарик установлен на прецизионный сверлильный станок опытного производства лаборатории Наномир.
http://img-fotki.yandex.ru/get/9/158289418.3/0_7de69_3b78ac2f_L.jpg 

После сверления вдоль оптической оси будет контролироваться добротность резонатора в 5-мм диапазоне, хотя для этого пока ещё не удалось приобрести детекторную секцию 5-мм диапазона. Этот специфический товар так быстро не купишь... 

 Обсуждение


Напоминаем, что в декабре 2012 года планируется международная

экспедиция к истоку озера Титикака / Titicaca,

т.е. к мегалитическому комплексу Тиванаку / Tiwanaku.


21 декабря, в день зимнего противостояния, по традиции в Тиванаку соберутся тысячи шаманов и паломников. Они будут праздновать открытие ворот Солнца. Цель нашей экспедиции - исследование мегалитического комплекса Тиванаку / Tiwanaku и истока озере  Титикака / Titicaca. Тем не менее желающие могут не только исследовать, но и участвовать в празднике "по полной программе". Праздник будет длиться 3 дня, а экспедиция значительно дольше (от недели до месяца). Все желающие присоединиться к нашей экспедиции могут это сделать, послав письмо по адресу: kushelev20120 yandex.ru или сообщение на форум лаборатории Наномир. Стоимость участия в экспедиции (стоимость билетов, проживание и питание) от 2000 евро (три дня), от 3000 евро (неделя), от 5000 евро (месяц). Независимая поездка скорее всего будет дороже, т.к. кооперация всегда удешевляет мероприятие.

Приглашение на праздник на официальном сайте министерства Боливии:http://www.rree.gob.bo/

http://cnnespanol.cnn.com/2012/08/01/bo … coca-cola/

Автоперевод:

МИНИСТР ИНОСТРАННЫХ ДЕЛ приглашает принять участие в празднике "летнее солнцестояние"

Советник канцлера, Давид Чокеуанка, 25 октября официально пригласил на международный праздник "Летнее солнцестояние", который будет являться исторической вехой, знаменующей собой начало новой эры на планете.

Боливийский министр иностранных дел подчеркнул значимость события 21 декабря 2012
года. "Нас ждут перемены планетарного масштаба. Мы столкнулись с глобальным кризисом... призываю все общественные движения найти себя в этом новом центре энергии Матери-Земли, священном озере инков, Титикака. Озере "Wiñaymarka» (вечных людей)", - сказал канцлер Чокеуанка.

Он подчеркнул, что исследования периода расцвета майя показывают, что Pacha Ajayu (энергия), является прожектором, освещающим человечество. Его источник находится в этом регионе более 3600 лет.
Сейчас заканчивается этот период и начнется новый цикл в 3600 лет и энергетический центр будет расположен на берегу озера Титикака, в бухте Хона из Sun Island. С изменением энергии системы изменится и порядка жизни, которая влечет за собой изменение в поведении человечества: от индивидуализма к коллективизму, мир взамен насилия, любовь взамен ненависти, радость взамен печали. Боливийское правительство созвало международную встречу духовных лидеров, местных и иностранных общественных организаций на берегу озера Титикака 21 декабря, чтобы закрыть цикл календаря майя и открыть новый цикл равновесия.

Министр иностранных дел также проинформировал послов и представителей международных организаций, всех, кто хочет участвовать в этом мероприятии может пойти на «Священное озеро», которое является общим
для Боливии и Перу в Андском регионе обеих стран.

На сегодняшний день подтвердили свое участие делегаций из 40 стран мира, среди которых азиатские, мусульманские, европейские и южноамериканские.

Ла-Пас, 25 октября 2012

Материал с форума лаборатории Наномир: 

Кушелев: Большая экспедиция начинается с большого праздника (С) 

Желающие участвовать в празднике могут отпраздновать это событие "по полной программе", а после завершения праздника (если есть желание) присоединиться к исследовательской группе, которая будет вести прямую трансляцию с мегалитического комплекса  Тиванаку / Tiwanaku. Продолжительность экспедиции планируется от недели до месяца. Местные жители, которые будут принимать участие в экспедиции смогут продолжить исследование и позже. Особенностью интерактивной экспедиции будет возможность управлять ходом исследования в реальном времени. Можно будет проверять различные гипотезы, концентрировать внимание на конкретных элементах мегалитического комплекса, корректировать методику исследования и т.д. Параллельно с онлайн-трансляцией с веб-камер будут пересылаться качественные видеозаписи и фотографии и публиковаться на серверах, обсуждаться на форуме лаборатории Наномир.

В процессе подготовки к экспедиции будут проанализированы результаты наиболее информативных экспедиций-предшественников. В частности, будут разобраны результаты экспедиции группы Андрея Склярова. 

 

Подробности из лаб. Наномир 1 2 3

  

Напомню также, что в районе озера Титикака / Titicaca обнаружены более 10 мегалитических объектов, которые, вероятно, ускользнули от внимания исследователей. Это может означать, что нас ждут десятки научных открытий...

 Обсуждение.


 Анализируем материалы экспедиции группы Андрея Склярова в Боливию

 

 Иллюстрация из книги Андрея Склярова.

Кушелев: Вероятно, этот музейный экспонат представляет собой копию инопланетного девайса, "летающей тарелки", основой двигателя которой является супермагнетрон, рассчитанный на колебательную моду с осью симметрии третьего порядка. По трём нечётным проводникам, заполненным клеточками "вафильного фильтра", электромагнитная волна рспространяется с задержкой по отношению к чётным (гладким) спиральным проводникам. Реальный девайс инопланетной разработки должен быть изготовлен по магнетронной технологии, т.е. с высокой степерью симметрии и со скин-слоем, выполненным из хорошего проводника, например, серебра.

  

  

Кушелев: Вероятно так выглядели разные пришельцы, которых видели люди, населяющие Боливию и Перу. 

 

 Группа Андрея Склярова посетила музей Кабреры.

Кушелев: Общее количество камней Ики оценивается в 50 000 штук. 

 

 Кушелев: Справа вверху мы видим промежуточную форму между трезубцем и звездой...

Интересно было бы смоделировать этот мобильный ускоритель в программе HFSS... 

 

 Цитата: Рис. 67. «Головы-украшения» в Чавине, Тиауанако и Теотиаукане

 

 Кушелев: Надеюсь, что Андней Скляров не забывает брать пробы воды из родников в зоне мегалитических комплексов...

 

 Связь мегалитов с родниками очевидна...

 

Мегалиты построены там, где текут растворы драгметаллов ... 

 

Саксайуаман (схема мегалитического комплекса) 

Кушелев: Из "бассейна-вороки" мощный родниковый поток направлялся вдоль зигзагообразной стены, создающей турбулентность. Это приводило к хорошему перемешиванию раствора драгметаллов, что необходимо для оптимального протекания химических реакций, используемых для добычи драгметаллов из родниковой воды. 

 

Цитата: Рис. 103. Поверхности сопряжения на разошедшихся блоках 

 

 Рис. 104. Следы на воротах в Саксайуамане и в асуанской каменоломне

 

Рис.106. «Ритуальный бассейн» Саксайуамана 

 

Рис. 117. Изрезанная гранитная скала

 

 Рис. 133. Храм Десяти Ниш

 

 Кушелев: Формирователи турбулентности

 

 Кушелев: Выпариватель проточного типа, "Акведук инков" :)

 

Что же за драгметалл добывали инопланетяне из родниковой воды в Макчу-Пикчу? 

Обсуждение. 


  Приглашение к сотрудничеству

для людей умеющих самостоятельно мыслить; не просто умных, а мудрых, которые чувствуют, где истина

Лаборатория Наномир готова к любому взаимовыгодному сотрудничеству. У нас есть  сторонники как явные, которые помогают морально и материально, есть очень много пассивных наблюдателей, есть и ярые противники, которые используют любые методы и средства (аморальные и просто преступные), чтобы уничтожить работу лаборатории и дискредитировать ее.

В одиночку внедрить технологии, выводящие цивилизацию на новый уровень,  невозможно. Благодаря поддержке множества заинтересованных людей проделана огромная работа. Ознакомиться с её результатами можно изучив материал рассылки "Новости лаборатории Наномир". Люди науки могут изучить научные труды.

Вклад каждого не останется незамеченным  в случае успеха в реализации научных проектов. Результаты совместной деятельности принадлежат участникам проекта пропорционально коэффициентам творческого и финансового участия.

Основные разработки: 

 Микроволновый источник энергии

В 2011 году были куплены рубиновые шарики для эксперимента на сумму ~1000 долл. В результате было сделано научное открытие, проверена защита диэлектрических резонаторов от перенапряжения. В этом году, вероятно, можно будет создать микроволновую энергетику, т.к. удалось найти сырьё (рубин #8 и гранат ИАГ-Ce), из которых сделаны рубиновые и гранатовые шарики для эксперимента в Дубне и в микроволновой печи.

Параллельно готовится эксперимент на рентгеновской установке в диапазоне 45 ... 96 ГГц. 

  "Эликсир вечной молодости"

28 сентября 2011г. в Институте геронтологии (г.Киев) начался эксперимент по созданию "эликсира вечной молодости". Благодаря первому взносу (в размере 500 долларов) Золдракса и поддержке других соинвесторов. В 2012-ом году в Институт геронтологии доставлены 200 клеток для лабораторных животных. За это время американские и японские исследователи определили полный гормональный спектра плаценты и эмбриона, используя 15 000 мышей. Начались переговоры с западным инвестором по поводу финансирования этого проекта.

Программа исследований Презентация

  Пикотехнология 

Созданы первые версии пикотехнологии (выпуски рассылки 212 270 271 272 ), с помощью которой Александр Кушелев и Виктория Соколик сделали более10 научных открытий.

Виктория Соколик: Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.

Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).

В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка. 

Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.

Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структурном шаблоне Вашего белка.

 Цена  заказов -- договорная. 

 Сотрудничество может быть различным:

- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)

- совместное создание коммерческого продукта

- поиск инвесторов

- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов

- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир

- содействие в проведении экспериментов и т.п.

- написание совместных научных статей и т.п.

- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)

 

Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир.

+7-926-5101703  +7-903-2003424 +7-916-8265031, Skype: Kushelev2009, mail: kushelev2011@yandex.ru

веб-мани: WM-кошелек R426964799301 Другие способы перевода

 


В избранное