Отправляет email-рассылки с помощью сервиса Sendsay

Новости лаборатории Наномир

  Все выпуски  

787 Вторая жизнь теории валентности. Пикомеханизмы изменения, расщепления химических связей.


Выпуск 787

Лаборатория Наномир

Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и  меркнут чудеса ...

 

Вторая жизнь теории валентности. Пикомеханизмы изменения, расщепления химических связей.

Теория валентности была опровергнута полуторными связями в бензоле и других сопряженных системах, но она удобна для решения обширного класса химических задач, поэтому её до сих пор изучают в школах и ВУЗах. Сегодня мы разберёмся с парадоксами теории валентности с помощью пикотехнологических моделей бензола и экзотических химических соединений. Пикомеханизмы наглядно покажут границы применимости теории валентности. Мы сможем дать теории валентности вторую жизнь для решения задач, использующих типовые пикотехнологические модели.

 

Мы уже знаем, что химические связи условны, но являются удобным представлением для решения обширного класса химических задач. Достаточно ввести в теорию валентности дробно-валентные химические связи, и она приобретёт вторую жизнь. На модели аминокислотного остатка мы видим, что атомы N(i+1) и C alpha соединены не только с атомом C' группы СО, но и между собой одной точкой контакта кольцевых электронов. Это означает, что связи C'-Ca и C'-N не одинарные, а 2/3-валентные, т.к. контактируют только через 2 точки. При этом присутствует 1/3-валентная связь Ca-N.

Пикотехнологическая модель помогает исправить структурную формулу аминокислот и белков.


Это - структурная формула из современного учебника. 


А это - исправленная структурная формула.

Таким образом, можно подправить структурные формулы обширного класса химических соединений, после чего к ним можно будет более корректно применить теорию валентностей. А это значит, что теория валентностей получает вторую жизнь. 

 Обсуждение


 Какова электронная структура свободного атома углерода?

 

В современной таблице Менделеева мы видим, что у атома углерода две электронные оболочки. На первой находятся 2 электрона, на второй 4. Но так ли это на самом деле?

Известно, что при нормальных условиях легко образуется графит, т.е. сопряженная система атомов углерода. Алмаз с тетраэдрической структурой атомов углерода при нормальных условиях получить затруднительно. Отсюда следует, что одиночные атомы углерода имеют сопряженную электронную структуру, т.е. на первой оболочке находятся 2 электрона, на второй ещё 2 и на третьей ещё 2. При объединении таких атомов углерода возникает сопряженная структура типа графита, бензола, азотистых оснований ДНК/РНК, порфириновые кольца и т.д.

 

Подробнее 

Обсуждение


 

"Кварки" белкового и добелкового миров

 

 

 

Три точки контакта электронов в молекуле можно образно назвать тремя "кварками" белкового и добелкового миров. Дело в том, что точки контакта выполняют функции упорных подшипников, поэтому являются основой пикомашин белкового и добелкового миров. Одно из фундаментальных достижений, которое привело к появлению белкового мира, явилось использование суставного молекулярного механизма полуацетали в элементах, из которых строятся белковые молекулы. В добелковом мире суставы делались, например, из минорных нуклеотидов, что очень затратно. Интеграция сустава в элемент строительной конструкции помог радикально снизить затраты на гибкость макромолекул. 

Обсуждение


 Субкварки ядерного мира

Структура атомного ядра стабилизируется тоже с помощью точек контакта, но не между электронами, как в мире молекул, а между кварками.

 

 Подробнее

Модель нуклона, состоящего из трёх кварков 

 

Модель атомного ядра. Красным показаны протоны, голубым - нейтроны 

Эти точки контакта тоже являются основой архитектуры атомных ядер. Если удастся создать суставы, аналогичные аминокислотам, то жизнь сможет развиваться уже не на атомном, а на ядерном уровне.

 Обсуждение


 Субпланкионы

Планкионная структура наномира (аксонометрия, близкая к виду спереди)


 Планкионная структура наномира (аксонометрия)

Субпланкионы - те же точки контакта, но уже не между кварками, а между планкионами, образующими структуру наномира (эфира Фарадея-Максвелла). Планк-технология позволит в будущем создавать механизмы из элементов наномира. Их существование уже не будет связано с веществом и даже с элементарными частицами. 

Обсуждение


 

Скрипт, используемый для создания модели гипотетической молекулы Кушелева

-- Nanoworld Laboratory
-- Alexander Kushelev
-- kushelev20120@yandex.ru
-- nanoworld88.narod.ru
-- nanoworld88.ru
-- 2021-11-20
c = torus radius1:0.85 radius2:0.03 segs:20 sides:12 position:[0,0,0] wirecolor:[255,255,255]
c1 = copy c wirecolor:[255,255,255]
c1.pivot=[0,0,0]
rotate c1 90 [1,0,0]
move c1 [0,1.15,0]
c1.pivot=[0,0,0]
rotate c1 15 [1,0,0]
move c1 [0,0,1.04]
c2 = copy c1 wirecolor:[255,255,255]
c1.pivot=[0,0,0]
rotate c2 90 [0,0,1]
c3 = copy c2 wirecolor:[255,255,255]
c3.pivot=[0,0,0]
rotate c3 90 [0,0,1]
c4 = copy c3 wirecolor:[255,255,255]
c4.pivot=[0,0,0]
rotate c4 90 [0,0,1]
c5 = copy c wirecolor:[255,255,255]
c5.pivot=[0,0,0]
rotate c5 90 [1,0,0]
move c5 [0,1.15,0]
c5.pivot=[0,0,0]
rotate c5 -15 [1,0,0]
move c5 [0,0,-1.04]
c6 = copy c5 wirecolor:[255,255,255]
c6.pivot=[0,0,0]
rotate c6 90 [0,0,1]
c7 = copy c6 wirecolor:[255,255,255]
c7.pivot=[0,0,0]
rotate c7 90 [0,0,1]
c8 = copy c7 wirecolor:[255,255,255]
c8.pivot=[0,0,0]
rotate c8 90 [0,0,1]
--
c9 = copy c wirecolor:[255,255,255]
c9.pivot=[0,0,0]
rotate c9 90 [1,0,0]
move c9 [0,1.35,0]
c9.pivot=[0,0,0]
rotate c9 45 [0,0,1]
c10 = copy c9 wirecolor:[255,255,255]
c10.pivot=[0,0,0]
rotate c10 90 [0,0,1]
c11 = copy c10 wirecolor:[255,255,255]
c11.pivot=[0,0,0]
rotate c11 90 [0,0,1]
c12 = copy c11 wirecolor:[255,255,255]
c12.pivot=[0,0,0]
rotate c12 90 [0,0,1]
--
c13 = copy c wirecolor:[255,255,255]
move c13 [0,0,2.19]
c14 = copy c wirecolor:[255,255,255]
move c14 [0,0,-2.19]
--
c15 = copy c wirecolor:[255,0,0]
scale c15 [0.9,0.9,0.9]
move c15 [0,0,1]
c16 = copy c15 wirecolor:[255,0,0]
move c16 [0,0,0.3]
c17 = copy c wirecolor:[255,0,0]
scale c17 [0.9,0.9,0.9]
move c17 [0,0,-1]
c18 = copy c17 wirecolor:[255,0,0]
move c18 [0,0,-0.3]
--
delete c
--
o1=sphere radius:0.03 segs:20 position:[0,0,1.15] wirecolor:[255,0,0]
o2=sphere radius:0.03 segs:20 position:[0,0,-1.15] wirecolor:[255,0,0]
h1=sphere radius:0.03 segs:20 position:[0,1.5,1.5] wirecolor:[255,255,255]
h2=sphere radius:0.03 segs:20 position:[0,1.5,-1.5] wirecolor:[255,255,255]
h2.pivot = [0,0,0]
rotate h2 90 [0,0,1]
--
b1=box length:0.02 width:0.02 height:2.3 pos:[0,0,-1.15] wirecolor:[255,255,255]
b2=copy b1 wirecolor:[255,255,255]
b2.pivot=[0,0,-1.15]
scale b2 [1,1,0.66]
rotate b2 -103 [0,1,0]
b3=copy b1 wirecolor:[255,255,255]
b3.pivot=[0,0,1.15]
scale b3 [1,1,0.66]
rotate b3 103 [1,0,0] 

 Обсуждение


 Создан онлайн сервис "Определение структуры белка по нуклеотидной последовательности"

Профессиональный онлайн-сервис 

Определены структуры всех белков человека Часть 1 Часть 2


3D генетический код подтвержден методами РСА, ЯМР и КД:

 

  
   


На базе научного открытия нами создан онлайн-сервис по определению структуры белковых молекул. Теперь мы сможем зарабатывать вместе.

Презентация для заказчиков белковых структур 

По старой технологии определение одной структуры белка обходится примерно в 10 000 евро, а ждать нужно от 2 месяцев до 3 лет. По новой технологии структура определяется в 1000 раз точнее и в миллиард раз быстрее. 80% от найденного Вами заказа принадлежат Вам, как менеджеру.

Наш лозунг: "В 1000 раз лучше, в 1000^3 быстрее и в 1000 раз дешевле!"

Ваша задача заключается в размещении рекламы на онлайн-сервис белковых структур. Рынок этих структур очень большой и продолжает стремительно расти. Ежедневно кто-то оплачивает до 60 структур по средней цене 10 000 евро за штуку. Новая технология позволила на одном персональном компьютере за неделю определить структуры всех 115 000 белков человека, для которых известна нуклеотидная кодирующая последовательность. При этом качество результата, полученного по новой технологии в 1000 раз выше по точности, в миллиард раз по быстродействию и в 30 раз шире по номенклатуре белковых молекул. Единственное, что нам сегодня не хватает - рекламы.

Как получить Вашу первую зарплату менеджера? Найти заказчика белковых структур  и убедить его заказать за счёт лаборатории Наномир пробный заказ. Когда заказчик распробует новую технологию, он начнёт делать коммерческие заказы. С первого коммерческого заказа менеджер получает 80%. С последующих заказов процент будет постепенно уменьшаться, но с первого заказа другого заказчика менеджер снова получит 80%. Зарплата менеджера может достичь миллиона евро в день. И это не предел.


Фрагмент модели лизоцима, замкнувшийся через дисульфидный мостик в процессе автоматической сборки по таблице композиционного генетического кода.


 Нуклеотидная кодирующая последовательность этого белка: 

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/api/embl/J05582.1?lineLimit=1000

Вторичная структура этого белка подтверждена экспериментально: https://www.uniprot.org/uniprot/P15941

 

Однако исследователи заметили лишь петли фрактальной 1141411141411119(98)557-спирали. Они решили, что петли состоят из бета-стрендов.

Развёрнутая схема вторичной структуры одного периода.

Программа Пикотех 2D показывает, что этот белок действительно имеет петлевую структуру, но петли состоят не из бета-стрендов, а из гибридной альфа-310-спирали. 1141411141411119(98)557-спирали. Это значит, что современные экспериментальные методы могут не отличить альфа-спираль от других структур. Пора исправить это досадное недоразумение...

 

Словарь вторичных структур:



Подробнее: https://picotechnology-of-proteines.nethouse.ru/  

Вторичная структура белка (фрактальная программная спираль) в компактном изображении: 


Подробнее

Первая 1000 белковых структур за счёт лаборатории Наномир (по старой технологии это стоило бы 10 миллионов евро). 

Обсуждение


Инвестирование научных проектов

Приглашаем инвесторов и меценатов.

Как продвинуть цивилизацию на новый уровень своего развития и получить при этом огромные прибыли?

- Вложить деньги
в научные разработки.

Новейшие виды экологически чистых и мощных источников энергии, средство для продления жизни, 
высокие технологии.

Все это реально создать в ближайший год-два при наличии достаточного финансирования.

Готовые коммерческие продукты

1. Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY

2. Сверхдобротные одномодовые диэлектрические резонаторы в т.ч. с большим диапазоном перестройки

3. Станки для производства высокодобротных одномодовых резонаторов 

4. Технология изготовления сапфировых линз 

5. Магнитный тороидально-сферический конструктор

Проекты

01 Ruby Emdrive (Микроволновый двигатель без реактивной струи)

02 Ruby Power Source (Микроволновый источник энергии) 

03 Средство продления жизни (Возвращение молодости)

04 Октаэдрический редуктор

05 Шестеренчатая передача Кушелева

06 Магнитный подвес-стыковка-герметизация модулей

07 Ионно-микроволновый фрактальный излучатель

08 Гибкий отражатель из жестких элементов

09 Энциклопедия "Наномир"

10 Экспертиза

11 Конструктивные компьютерные игры

12 Интеллектуальный кодовый замок

13 Очки кругового обзора

14 Тетраэдрический сканер

15 Программируемая архитектура

16 Источник энергии промышленной частоты

17 Источник энергии постоянного тока

18 Монокристаллическая видеокамера

19 Система определения активных участков белка

20 Тераваттный лазер непрерывного действия

21 Бактериальный синтез алмазов

22 Шестеренчатые передачи с тремя степенями свободы

23 Сверхсветовая связь

24 Безосевая шестеренчатая передача

25 Aктивный язык программирования

26 Телевидение миллиметрового и оптического диапазонов

27 Микроволновая архитектура

28 Компьютерный экран из автономных элементов

29 Чтение / запись ДНК

30 Сверхсветовая локация / зрение

31 Нейтрализатор акустического сигнала

Коммерческое предложение: 

Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.

Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).

В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка. 

Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.

Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структуре Вашего белка.

 Сотрудничество может быть различным:

- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)

- совместное создание коммерческого продукта

- поиск инвесторов

- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов 

- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир

- содействие в проведении экспериментов и т.п.

- написание совместных научных статей и т.п.

- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)

 

Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир.

+7-926-5101703  +7-903-2003424, mail: kushelev20120@yandex.ru

Карта VISA Сбербанка  4276400045661130

PayPal: kushelev20120@yandex.ru (вариант перевода друзьям) 

веб-мани: WM-кошелек R426964799301

Кошелек Яндекс-деньги: 410011905885672 

Огромное спасибо всем за помощь и поддержку!     


В избранное